申请日本留学的时间安排如下：

提前了解申请时间

日本的大学和研究生院的申请截止日期通常在每年的 1月底或2月初。因此，学生需要在这之前完成所有的申请材料准备工作。

考虑日本的入学时间

日本的大学和研究生院通常有两个入学时间：春季入学和秋季入学。春季入学一般是在4月，而秋季入学则是在9月或10月。大部分学校都提供这两个入学时间的选择，但有些专业可能只有春季入学或秋季入学的选项。

具体申请步骤

6~9月份：选择一个日本留学预科教育学校学习或者留学中介，制定留学方案。国内留学预科院校、日本留学申请时间一般在4月-10月招生，8月中下旬开课，9月、10月学生可以中断。

7~11月份：准备留学申请材料，学校对学生通过提交的申请材料方面进行分析审核、调查，不妥之处进行数据修改。

次年2~3月份：获取企业申请研究结果，汇学费，办理以及日本留学签证，订购机票，准备进行留学。

语言学校申请时间

日本语言学校通常一年招生4次， 开学时间分别为1月、4月、7月、10月。4月份开学的那期招生人数是特别多的，其次为10月、7月、1月开学的。大部分语言学校都是集中招收4月和10月开学的那两期，也有部分学校招收1月和7月开学的那两期，但总体来说不多。就报名时间来说，一月生是在前一年9月之前；4月生是在前一年的11月之前；7月生是在当年2月之前；10月生是在当年5月之前。

大学学部申请时间

日本大学一般只有4月开学这期招收留学生，也有少部分院校招收9月或10月开学的。4月份开学的国公立大学，是从前一年年末到入学年的2-3月份进行报名和考试；4月份开学的私立大学，是从前一年的秋季到入学年的1-2月份进行报名和考试。

大学院申请时间

日本大学大学院招收硕士生和博士生，一般只招收4月开学这一期，也有少部分院校招收9月或10月开学的，还有部分院校设有其他开学时间。4月开学那期，通常是在前一年的秋季到入学年的3月份左右进行报名和考试。

综上所述，日本留学的最佳申请时间是在每年的1月底或2月初之前，具体时间取决于所选择的入学时间和学校的要求。建议提前了解并确认目标学校和专业的具体申请时间，以便及时准备申请材料。